Nindirí es una palabra chorotega o mangue que significa "Altura de la Cochinilla".

A la llegada de los españoles, a principios de la segunda década del siglo XVI, Nindirí tenía un promedio de 30.000 pobladores, exterminados casi totalmente al finalizar la conquista.

Los pobladores de estas tierras pertenecían a las tribus dirianes, descendientes de los chorotegas o mangues cuya procedencia era de choluca, quienes al ser desalojados del centro de México, establecieron cacicazgos entre el Golfo de Fonseca y Nicoya.

En la época precolombina, la zona era conocida con el nombre de Nindirí y Lenderí, y el cacicazgo que presidía la ciudad principal era Tenderí.